ویژگی های میکروبی و کلینیکی باکتری Eggerthella lenta

چکیده

Eggerthella lenta پاتوژنی است که به خاطر دشواری شناسایی فنوتیپی آن مورد توجه قرار نگرفته است. تا کنون، پاتوژنیسته و پروفایل حساسیت میکروبی آن و تیمار بهینه اش به طور ضعیفی شناخته شده است. در این مطالعه ما بزرگترین مجموعه از بیماران مبتلا به باکتریمی E. lenta تا کنون را گزارش کردیم و به طور دقیق ویژکی های کلینیکی و میکروبی و تیمار و بازده آن را بررسی کردیم. با شناسایی 33 بیمار، با میانگین عمر 68 سال که هیچ برتری جنسیتی. وجود نداشت 27 تا از بیماران اسیب های داخل شکمی شدیدی داشتند که اغلب نیاز به روش های درمانی داشتند .میزان مرگ و میر در طی 7 روز ، 6درصد بود و 12 درصد طی 30 روز و 33 درصد در یک سال.بود از 26 ایزوله در دسترس برای مطالعات بعدی، همه ی انها به عنوان E. lentaشناسایی شدند با هر دو روشmatrix-assisted laser desorption ionization time of flight mass spectrometry (MALDI-TOF MS) systems  و هیچ کدام از انها ژن vanA or vanB را نداشتند. از 23 جدایه که مورد بررسی حساسیت میکروبی قرار گرفتند همه انها به amoxicillin-clavulanate, cefoxitin, metronidazole, piperacillin-tazobactam, ertapenem, meropenem, حساس بودند، 91 درصد به clindamycin حساس بودند و 74 درصد به moxifloxacin و 39 درصد به penicillin.حساس بودند.

مقدمه:

Eggerthella lenta یک باکتری باسیل گرم مثبت، بی هوازی فاقد اسپور از خانواده Coriobacteriaceae  میباشد که اولین بار توسط Arnold Eggerth در سال 1935 توصیف شد. این باکتری مورد برسی های بیشتری قرار گرفت وEubacterium lentum نامیده شد تا سال 1999 که بر اساس انالیزهای ژنتیکی در جنس خودش قرار گرفت. دو گونه نزدیک به آن به نام های Paraeggerthella hongkongensis و sinensis, Eggerthella نیز اخیرا شناخته شده است. توالی کامل ژنوم نیز برای اولین بار در سال 2009 منتشر شد.

به خاطر سختی های شناسایی ازمایشگاهی، اطلاعات کمی در مورد طیف بیماری منتشر شده است و درمان بهینهE. lenta بخشی از میکروبیوم دستگاه گوارش انسان است و معمولا همراه با عفنونت هایی با منشا دستگاه گوارش است. چندین بیماری منتشره از آن توصیف شده ورنج مرگ و میر آن بین 36 درصد تا 43 درصد می باشد. امروزه به علت پیشرفت در تکنیک های شناسایی و توالی یابی های مولکولی شناسایی این باکتری امکان پذیر شده است. اخیرا مشخص شده استفاده از اسپکتومتری MALDI-TOF MS))[1] قادر به شناسایی سریع E. lenta می باشد.

استفاده از تست های حساسیت ضد میکروبی برای بی هوازی ها به ازمایشگاه های رفرنس خاصی محدود می شود بنابراین درمان ضد میکروبی برای بیماران با عفونت حاصل از باکتری های بی هوازی اغلب تجربی می باشد.در هر حال ایجاد مقاومت در بین ارگانیسم های بی هوازی در حال افزایش است، بدست اوردن اطلاعات حساسیت برای راهنمای درمان مهم میباشد. اطلاعات چاپ شده در مورد الگوی حساسیت این باکتری کم می باشد . در سال 2001 ،استینر و همکارانش یک روش غربال گری سریع بر اساس PCR را برای تشخیص از مدفوع حاملین انتروکوک مقاوم به ونکومایسین (VRE) را گسترش دادند در حالی که انها لوکوس vanB را در Eggerthella lentaشناسایی کردند، حدس زدند که فلور گوارشی بی هوازی ممکن است نشان دهد منشا VRE و نشان نداد که E. lenta قادر است مقاومت به ونکومایسن را بدست اورد.

در این مطالعه 33 بیمار مبتلا به E. lenta مورد برسی قرار گرفته اند و یژگی های کلینیکی، شناسایی فنوتیپی و ژنوتیپی و تست حساسیت ضد مکیروبی آن گزارش شده است.

مواد و روش ها

این مطالعه در استرالیا در سال های 2000 تا 2013 انجام شده. غربال اولیه بر اساس مثبت شدن کشت خون Eggerthella lenta. یا Eubacterium lentum انجام شد.

کشت خون: E. lenta از کشت خون بی هواری BacT/Alert با استفاده از سیستم تشخیص میکروبی BacT/Alert three-dimensional (3D) غربال شد.

شناسایی ایزوله ها: ایزوله ها پس از 48 ساعت کشت بر روی پلیت Oxoid Anaero از طریق چندین روش شناسایی شدند. شناسایی فنوتیپی بر اساس رنگ امیزی گرم، مورفولوژی کلنی و نتایج Vitek-2 ANC می باشد. شناسایی MALDI-TOF با کمک سیستم های تجاری انجام شد.انالیزهای بعدی با کمک اسپکتوفتومتری جرمی انجام شد.

جهت شناسایی ژنتیکی، پس از استخراج DNA، توالی یابی 16S rRNA انجام شد.

تست بررسی حساسیت میکروبی برای ایزوله های E. lenta به همراه سویه استاندارد E. lenta strain ATCC 43055توسط روش های استاندارد انجام شد.

van gene PCR: پس از کشت باکتری و استخراج DNA، Real-time PCR برای ژن های vanA and vanB انجام شد.

نتایج:

اطلاعات کلینیکی بیماران در جدول 1و 2 امده است. میانگین عمر این 33 بیمار 68 سال میباشد. 52 درصد خانم بوده اند.بخش اعظم بیماران دچار بیماری های اولیه بودندو 39 درصد انها نیز دچار باکتریمیا چند میکروبی توسط انواعی از ارگانیسم های انتریک بودند. کشت خون بعد از حدود 3 روز علائم رشد را نشان داد.بارزترین علامت تب و دردهای شکمی بود. 67 درصد بیماران در طی زمان باکترمی تعداد گلبول های سفید غیر عادی داشتند و مقدار CRP در 31 بیمار افزایش یافته بود.

تصاویر گوارشی تهیه شده در بیش از نیمی از بیماران در سه چهارم انها غیر طبیعی بود. تیمار های بعدی انها بسته به نوع پاتولوژی متفاوت بود. انتی بیوتیک درمانی نیز متفاوت بود. پنج نفر از بیماران هیج انتی بیوتیکی دریافت نکردند و همه انها دریکسال زنده بودند. انها بیمارانی با بیماری خود محدود شونده بودند که بهبود های کلنیکی انها توسط کشت خون مشخص شده بود. انهایی که انتی بیوتیک گرفتند متوسط دوره انها 21.5 روز بود.انواع مختلفی از انتی بیوتیک ها مصرف شد. که اغلب رژیم ها حاوی مترونیدازول یا اموکسیسیلین کلاونات بود. میزان مرگ ومیر در همه بیماران 6 درصد در 7 روز، 12 درصد در سی روز و 23 درصد در یک سال بود.

شناسایی ایزوله ها:

28 جدایه برای برسی های بیشتر در دسترس بود. همه انها به عنوان E. lenta تایید شدند با استفاده از توالی یابی های ژنتیکی. 26 ایزوله در سطح جنس تائید شد که 19 تای انها به عنوان E. lentaشناسایی شدند.

تست حساسیت ضد میکروبی: جدول 3 نتایج تست حساسیت را برای 23 جدایه E. lentaنشان می دهد. همه سویه ها به انتی بیوتیک های amoxicillin-clavunat , cefoxitin, metronidazole, ertapenem, piperacillin –tazobactam, meropenem حساس بودند. حساسیت به clindamycin 91 درصد بود به moxifloxacin 74 درصد بود و به penicillin 39 درصد بود. همه انها به ceftriaxone. مقاوم بودند. با استفاده از EUCAST breakpoints ،تمام به هم شبیه بود به جز پنیسیلین و پنسیلین –تازوباکتام که هیچ جدایه ای به آن حساس نبود.

van gene PCR.: همه 23 ایزوله تست شدند همه برای ژن های vanA and vanB منفی بودند.

بحث:

گزارش ما بزرگترین و کامل ترین مطالعه بیماران میتلا به باکترمی E. lenta شرح داده شده در مقالات تا به امروز را. ارائه میدهد. نتایج ما پیشنهاد میکند که باکترمی E. lenta با رنج وسیعی از بیماری ها مرتبط هست از باکترمیای بی علامت گرفته تا باکترمیای چند میکروبی. بخش قابل توجهی از بیماران دچار اسیب های پاتولوژی دستگاه گوارشی بودند و اغلب به جراحی و یا مراقبت های ویژه ICU نیاز داشتند. بنابراین پیشنهاد می شود که هنگام شناسایی در کشت خون E. lenta نباید لزوما به عنوان یک الودگی تلقی شود بلکه باید یک اغازی باشد برای بهبود دقیق تر بیمار و تشخیص بهتر بیماری.

گزارش های چاپ شده از باکترمی E. lenta در جدول 4(موجود در مقاله) امده است. مطالعه ما کمی از مطالعات قبلی متفاوت تر است. gopal Venu و همکارانش بر روی 25 بیمار مطالعه کردند اما بررسی های میکروبی انجام نشد و بر روی علائم بالینی مطالعه صورت گرفتLee و همکارانش نیز بر روی 7 بیمار دچار باکترمی E. lenta مطالعه کردند که متوسط سنی تنها 56 سال بود. انها منشا عفونت را بررسی نکردند علی رغم این که 30 درصد بیماران علائم گوارشی داشتند .هم چنین شش گزارش در مورد باکترمی این باکتری وجود دارد که دو مورد آن بیماران با ابسه های چرکی گسترده را نشان میدهد که به تزریق انتی بیوتیک های درون رگی و یا عمل جراحی نیاز داشتند. گزارشاتی نیز از عفونت غیر باکترمی این باکتری امده است که شامل سینوزیت پیشانی،ابسه جلدی، ابسه کبدی میباشد. E. lentaحتی در پاتوژنز باکتریایی واژن و اپاندیسیت در کودکان گزارش شده است.شناسایی E. lenta با MALDI-TOF در ابتدا ممکن نبود به خاطر محدودیت در تعداد باکتری های بی هوازی موجود در ورژن های قبلی داده ها. در سال 2011 Justesen و همکارانش گزارش کردند یک E. lenta جدا شده که با روش Bruker MSبا استفاده از داده های به روز شده اما نه با روش MALDI-TOF MS. در مطالعات اخیر E. lenta به کمک روش BrukerMS به خوبی شناخته شده اند .مطالعه ما نشان داد E. lenta با اطمینان با هر دو روش در دسترس MALDI-TOF MS شناسایی شوند.

دسترسی به تست های حساسیت بی هوازی دشوار می باشد در هر حال عدم اطالاعات در دسترس برای  breakpoint منجر به استفاده از سایر گونه های بی هوازی برای E. lenta شد. نتایج تستهای حساسیت ما با نتایج قبلی سازگار بود که نشان داه اند که که این ایزوله ها اغلب به پنیسیلین مقاوم هستند و درجات متفاوتی از حساسیت به کلیندامایسین moxifloxacin را دارند اما به amoxicillin-clavulanate, cefoxitin carbapenems حساس باقی مانده اند.

علی رغم این که vanB قبلا در E. lenta در ازمایشگاه ما مشخص شده بود و مقدار بالای MICs ونکومایسن قبلا در گزارش اورده شده اما ما نه ژن های مقاومت به vanAیا vanB و نه مقاومت فنوتیپی را در ایزوله ها مشاهده نکردیم.

به طور خلاصه ، Eggerthella lentaبه نظر میرسد که یک پاتوژن مهم انسانی می باشد که اغلب مرتبط با اسیب های گوارشی است. اگر تشخیص در زمان کشت ارگانیسم در محیط خون اشکار نباشد برسی های جزئی تر گوارشی باید انجام شود. شناسایی سریع آن با کمک MALDI-TOF MSامکان پذیر شده است. به نظر میرسد قابل اعتماد ترین تیمار انتی بیوتیکی cefoxitin, metronidazole, amoxicillin-clavulanate carbapenems میباشد .

[1] laser desorption ionization–

time of flight mass spectrometry

تصنیف نت

فروشگاه اینترنتی تصنیف نت به منظور فراهم آوردن بستری مناسب جهت برقراری ارتباط با مشتریان عزیز راه اندازی شده است. این فروشگاه اینترنتی متفاوت از هر آن چیزی است که شما از یک فروشگاه اینترنتی تصور دارید. تمامی محصولات از جمله: لوازم التحریر ، نوشت افزار ، لوازم جانبی کامپیوتر ، خدمات آموزشی ، خدمات کامپیوتری و خدمات چاپ و صحافی و... در فروشگاه تصنیف نت قابل عرضه می‌باشد.